危机二：价外危机
按权证的内在价值，权证分为价内权证和价外权证，内在价值大于零的为价内权证，内在价值为零即无行权可能的为价外权证。对于认购权证而言，价内权证指行权价格与行权费用之和低于标的证券结算价格;对于认沽权证而言，则指行权费用与标的证券结算价格之和低于权证行权价格。例如，钾肥认沽权证将于2007年 6月25日进入行权期，行权价为15.1元，截至2007年5月31日收盘，盐湖钾肥收报41.18元，权证当日最高达6.5元, 盐湖钾肥至少跌至8.6元(=15.1-6.5)，权证才可能行权，显然这种可能性极小，因而钾肥认沽权证行权的可能性极小。
在权证内在价值为0的状况下，尤其是临近行权期时，投入价外权证的危机非常大。例如，万科认沽权证的最后一个交易日，权证全日单边下跌，最终跌幅达95%，倒数第二个交易日的跌幅达44.44%，部分投入者的损失超过100万元。
危机三：T+0危机
权证交易实行T+0交易，因为可以当天买卖，蕴含的投机气氛更浓，权证单个交易日可以被来回买卖N次，导致投入者对于资金动向及买卖市场实况更加难以判断，市场危机因而进一步加大。例如，某些炒作权证的短线资金大量交易、频繁回转，而导致散户盲目跟风以至于亏损。
危机四：行权危机
目前，一部分投入者由于对权证的行权原理不太熟悉，未及时对价内权证行权或者对价外权证误行权，导致了巨大的损失。如，有1661万份包钢价内认购权证未及时行权，投入者为此损失了5735万元;38060份大冶特钢价外认沽权利误行权，投入者为此损失了20.63万元。
危机五：市价委托危机
除以上危机外，权证交易中还存在因市价委托方式导致的危机，虽然出现这种危机的概率很低，但投入者也应加以注意。例如，2007年2月28日，投入者A 以市价委托卖出收盘价0.699元的海尔认沽权证82万份(实际成交价为每份0.001元)，56万变成820元，损失惨重。由于权证的涨跌幅区间巨大，因此，投入者在买卖权证时，务请注意谨慎使用市价委托方式，以避免造成不必要的损失。
